Emergency ha avviato in Sudan tre Centri pediatrici, a Mayo (dicembre 2005), Nyala (luglio 2010) e Port Sudan (dicembre 2011), dove offre cure ai bambini sotto i 14 anni e svolge attivitā di educazione igienico-sanitaria rivolta alle famiglie.
Attualmente le attivitā del Centro pediatrico di Nyala sono sospese, in seguito al rapimento di un membro dello staff internazionale di Emergency poi rilasciato.