Nella primavera 2003 Emergency ha portato all'ospedale Al Kindi di Bagdad (il principale centro chirurgico della città) oltre 30 tonnellate di farmaci, materassi, coperte e 45.000 litri di gasolio per rimettere in funzione i generatori di corrente e consentire la ripresa delle attività delle sale operatorie.

Nello stesso periodo, Emergency ha donato alcune tonnellate di farmaci all'ospedale di Karbala, la città sciita situata 90 chilometri a sud di Bagdad, favorendo il trasferimento dei pazienti più gravi al Centro chirurgico di Sulaimaniya.

A partire da maggio 2004, in cinque diverse spedizioni, Emergency ha fornito farmaci e altri beni di prima necessità (acqua, cibo, coperte, materassi...) all'ospedale e alla popolazione di Falluja, vittima di un assedio che l'aveva completamente isolata.